配合 Codex 使用指南

最重要的一点

不要从 GitHub 手动下载 zip、解压、复制技能目录。 本仓库是专门为 Codex（或兼容 .codex/skills + AGENTS.md 约定的 Agent）设计的。正确的方式是让 Codex 自己 clone 仓库、读取约定、发现技能。

在 Codex 对话中说：

请 clone https://github.com/M-24rjgc/research-workbench 到工作区，
然后读取 AGENTS.md，按 13 阶段路由开始科研。

Codex 会自动：

cp templates/.env.example .env
python3 .codex/skills/research-ledger/scripts/project_context.py --create <id> --title "<课题描述>"

如果你已有研究项目，希望沿用这套流程：

把这个仓库的 AGENTS.md、.codex/skills/、templates/ 复制到当前项目，
然后按 AGENTS.md 的 13 阶段路由继续工作。

注意：AGENTS.md 与 .codex/skills/ 必须位于项目根目录，Codex 才能自动发现。

阶段	你可以这样说
S1 选题/文献	“查一下 XX 方向近两年的文献，归纳热点和 gap，写入台账”
S2 审查方案	“用 scientific-brainstorming 评审这个研究方案”
S3 新颖性	“对 ‘XX idea’ 做查新，给出检索审计”
S4 数学验证	“用 math-verification 验证这个推导/公式”
S5 故事/动机	“写一页研究故事线：hook → 缺口 → 贡献”
S6 实验矩阵冻结/实现	“按项目协议冻结实验矩阵，实现并跑冒烟+三轮自检，出验收报告”
S7 实验运行/优化闭环	“先 pilot 试跑，再对 XX 调参/消融，达标后锁定配置跑 canonical”
S8 数据图	“用 nature-figure 出期刊级数据图”
S9 写作	“按 ARS academic-paper 流程起草论文初稿”
S10 示意图	“用 engineering-figure-agent 画系统架构图”
S11 排版/引用	“用 venue-templates 排版，并跑 nature-ref-verifier 核引用”
S12 三轮审查	“启动三轮连带审查”
S13 去 AI 味	“先跑保全审计，再跑 Writing Quality Check + researchwrite anti-slop 闭环”