GraphBuilder.py

• Erstellen des Graphen
• Download einer SNOMED CT-Version (RF2)
• Benötigte Dateien in den Ordner data legen:
  • sct2_Concept_Snapshot_INT_xxxxxxxx.txt
  • sct2_Relationship_Snapshot_INT_xxxxxxxx.txt
  • sct2_RelationshipConcreteValues_Snapshot_INT_xxxxxxxx.txt
• Zwei Arten von Graphen möglich - immer die Richtungsabhänigkeit beachten
• Werden gespeichert für spätere Verwendung

1. Graph mit nur is-a-Relationen

• Beim Erstellen des Graphen darauf achten, dass nur der Relationstyp 116680003 (is-a) verwendet wird.

2. Graph mit allen Relationen

• Enthält neben den is-a-Relationen auch alle Attributrelationen.
• Diese Variante kann zu spannenden Verbindungen durch Attributrelationen führen. 😉

Measures.py

• Für mein Projekt war die Berechnung der Semantic Similarity zwischen 2 Konzepten relevant
• Verschiedene Ansätz aus Literatur implementiert
• Publikation: 10.1016/j.jbi.2010.09.002

Worker.py

• Hilfsmethoden für die Berechnung der Semantic Similarity, wie Pfadlängen